harutamaの日記

失業中の理系研究者のブログ

2020-01-01から1年間の記事一覧

実効再生産数Rt計算 エクセルで簡単EpiEstimは何を計算しているか

御無沙汰しています。 すっかり忘れてしまいそうなので以前理解した内容を書いておきます。 エクセルでも簡単に実効再生産数Rtを計算できるEpiRstimについて EpiEstimの動作は、Step1、Step2からなる Step1 SIの分布(ws)を計算。 ここで、SI(Sireal Interval…

【新型コロナ】実効再生産数Rtをエクセルで計算したら1ヶ月後が見えた?(WHOお墨付きEpiEstimで)(3)

一昨日、昨日に続き、WHOお墨付きEpiEstimのexl版で実効再生産数を計算しました。 実効再生産数Rtは1人目から2人目にうつした倍率である事を利用すると、1ヶ月後が見えてくるかも知れない。 さっそく、エクセルで計算だ! 全国のRtはEpiEstimで0.9だったので…

【新型コロナ】実効再生産数Rtをエクセルで計算してみた(WHOお墨付き!?)(2)

昨日の続きです(ただし、使用するデータを2020/02/27-09/26に更新しました)。 WHOお墨付きのEpiEstimのexl版で出力したデータをエクセル上で加工します。 harutama.hateblo.jp (1) 新しいエクセルシートにEpiEstimのOutput2 R estimatesタブからRのmeanの…

【新型コロナ】実効再生産数Rtをエクセルで計算してみた(WHOお墨付き!?)

前回の書き込みから御無沙汰しております。 猛反省して新型コロナ(COVID-19)の論文を調べ、紆余曲折してはやウンヶ月。PythonとRのインストールにからかわれておりました。^^; 世界保健機構(WHO)報告(3月12日)から、再生産数の定義は以下 Rt (the effe…

【新型コロナ】何も対策しない場合の死者数がなんと!?

前回の反省から、ちゃんと修正しようと思っていろいろ調べておりましたが思いの外はまってしまい、このままでは飽きてしまって風化させる恐れがあるのでこれまで分かったところだけでも書こうと思います。 「何もしなければ41万人死亡」というのは4月に北大…

お詫び

先の以下のエントリーに誤りがありましたので、お詫び致します。誠に申し訳ありませんでした。 【新型コロナ】新型コロナで40万人死亡をエクセルで計算してみた 【新型コロナ】新型コロナで41万人死亡をエクセルで計算してみた(2) 【新型コロナ】新型コロ…

【新型コロナ】レムデシビルの医療崩壊期間の短縮効果をエクセルで計算してみた。

*お断り:申し訳ありません。この計算に用いたデータは古いデータ(4月22日時点)のため、汎用性はありません。 先日認可が下りた新型コロナの薬レムデシビルと、今後1年以内の認可を目指すイベルメクチンについて、事前投与した場合、推定死者数に対する効…

【新型コロナ】レムデシビルでも死者30万人!エクセルで計算してみた

*お断り:申し訳ありません。この計算に用いたデータは古いデータ(4月22日時点)のため、汎用性はありません。 AFPによれば、レムデシビルの効果は治療期間を31%減らし、致死率も31%減らすとのことだ。この値はアメリカでの治験によるので日本でも同じか…

【新型コロナ】帰省、いつするの?夏でしょ!

2020年12月~2021年1月の年末年始は、帰省できない。 おそらくそれまでに十分な効果のあるワクチンや治療法が間に合わないだろうから。年末年始は、風邪ウイルスのピーク期で、新型コロナも活発になり、医療崩壊を起こす危険性があるからだ。医療設備の乏し…

【新型コロナ】夏の高校野球できるかも?

テルモ販売の紫外線照射ロボ、新型コロナ除去の効果確認 この記事によれば、紫外線で新型コロナウイルスを除去できる。病院、公共交通機関、ホテルなどでも使用できそうだ。人間には使えそうにないけれど。マスク用もある。(PRTIMES)これで少し作業が楽に…

【新型コロナ】感染者情報流出

感染者495人分の氏名などを誤って掲載 愛知県のHP news.livedoor.com やっちゃいましたね、、 役所なんてところの個人情報の取り扱いのずさんさと来たら、恐ろしいからね。 個人情報管理がひどい団体ランキング 1.お役所、国や自治体関連 2.学校、専門学…

【新型コロナ】コロナ自殺?

とんかつ店店主が油を被ってコロナ自殺というショッキングな報道があった。 少し調べると、The Library webの記事から、2代目当主の54才男性、遺書は無いという事が分かる。遺書が無いなら自殺とは断定できない。ショッキングに伝えたいという意図の報道だろ…

【提案】バーチャル東京オリンピック

課題 新型コロナのために東京オリンピック開催が危うい。新型コロナの治療法確立に1年、十分な体制を整えるのに更に1年かかるとすれば、次のオリンピックが迫ってくるからだ。スポーツ選手は体が資本だから、参加諸国はコロナにかかる危険性を推してまで出場…

【新型コロナ】明るいニュースと経済復興

新型コロナの原因は血栓らしい事が分かってきたと(^^) 今まで原因が分からなかったから死亡率が高かったわけで、原因が分かれば重症化前に防げて死亡率は大幅に減るかも知れない。 一方、経済復興のキーワードはやはり、東京オリンピックでしょう。 新型コロ…

【新型コロナ】再生産数0.5の2ヶ月後をエクセルで計算してみた(自粛ダメじゃん?)

今話題の実効再生産数は日本疫学会によれば(正確に知りたい方は元のサイトをご参照下さい) 現実的な集団にある感染症を最初に持ち込んだ一人の感染者が、感染力を失うまでに(免疫の獲得もしくは死亡)、何人に感染させるかの数値 早速、感染者数の変化をe…

【新型コロナ】緊急事態宣言延長 半年後を考えた行動をしよう!

飲食店やエンタメは、今の緊急事態宣言の延長がキツイと言っている場合じゃあない! もし年末年始に稼ぎがなくてもやっていけるかどうかを考えよう。 2020年11月~2021年2月 もっと厳しい緊急事態宣言 なぜって、致死率をインフルエンザと同等に下げられる特…

【新型コロナ】新型コロナで40万人死亡をざっくり手計算してみた!

*お断り:申し訳ありません。この計算に用いたデータは古いデータ(4月22日時点)のため、汎用性はありません。 前提条件として、新型コロナがインフルエンザと同様に流布されるとする。・インフルエンザ感染者 729万人/年・インフルエンザ 致死率 0.001% …

【新型コロナ】新型コロナで41万人死亡をエクセルで計算してみた(2)

*お断り:申し訳ありません。この計算に用いたデータは古いデータ(4月22日時点)のため、汎用性はありません。 harutama.hateblo.jp に、医療崩壊の可能性を加えてみた。これには、ネット上にあった日本医師会様のデータを利用させていただいた。 この資料…

【新型コロナ】新型コロナで40万人死亡をエクセルで計算してみた

*お断り:申し訳ありません。この計算に用いたデータは古いデータ(4月22日時点)のため、汎用性はありません。 新型コロナで41万人の死者が出るとの発表があったそうな まじめに調べれば前提条件が分かるかも知れないが、、、エクセルで試算してみた <前…