【新型コロナ】実効再生産数Rtをエクセルで計算してみた(WHOお墨付き!?)(2)
昨日の続きです(ただし、使用するデータを2020/02/27-09/26に更新しました)。
WHOお墨付きのEpiEstimのexl版で出力したデータをエクセル上で加工します。
(1) 新しいエクセルシートにEpiEstimのOutput2 R estimatesタブからRのmeanの計算値をコピーし、Time periodの値に気をつけて、対応する年月日を貼り付ける。
(2) こんなグラフが簡単に描ける。
(2) こんなグラフが簡単に描ける。
(3) 左右の0.05quantileと0.95quantaileも使ってあげると、もっとカッコイイ(?)
【参考文献】
WHO(2020) Public health criteria to adjust public health and social measures in the context of COVID-19
Anne Cori(2013) A New Framework and Software to Estimate Time-Varying Reproduction Numbers During Epidemics