実効再生産数Rt計算 エクセルで簡単EpiEstimは何を計算しているか
御無沙汰しています。
すっかり忘れてしまいそうなので以前理解した内容を書いておきます。
エクセルでも簡単に実効再生産数Rtを計算できるEpiRstimについて
EpiEstimの動作は、Step1、Step2からなる
Step1 SIの分布(ws)を計算。
ここで、SI(Sireal Interval)は、一人目の発症からその人がうつした人が
発症するまでの期間。
Step2 Step1の結果を用いてRtを計算する。
過去の発症者の数(I(t-τ), τ=1,2,..s)にwsを畳み込み積分し(sはwsの最大長)、
I(t)をその値で割ったものがRt
とってもシンプル♪
ちなみに、ここまで紹介してきた以下の設定では、Step1は決め打ちにしています。
なので、実際に計算しているのはStep2のみです。
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